enFoldX 从 AF3 ensemble 提取 106 个界面特征
quaidmorris · x · 2026-07-22
enFoldX 的方法:把 AF3 ensemble 变成 106 个特征
这条帖更具体地解释了方法流程:
- 先用 10 个 seed × 5 个 sample 生成结构 ensemble;
- 对每个预测提取 106 个结构、置信度和生物物理特征;
- 重点关注 TCR:pMHC interface 和 peptide–CDR3 contacts;
- 再把每个特征在 ensemble 上的 均值 和 标准差 一起汇总。
核心思路是:不把 AF3 的不确定性当噪声丢掉,而是直接拿来做分类信号。
所属事件:enFoldX:将AlphaFold3结构噪声转化为TCR识别预测信号(11 条相关)→
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