Cherimoya Binding Atlas 发布:46k 参数小模型覆盖 3429 组转录因子结合数据

jmschreiber91 · x · 2026-10-31

作者团队发布 Cherimoya Binding Atlas(BATv1),一套基因组序列到功能(S2F)模型集合,覆盖来自 ENCODE 的 3,429 个转录因子结合 ChIP-seq 实验,涉及 183 种生物样本和 1,139 个不同靶点。

模型非常小巧:仅约 46k 参数,远小于 CATv1 可及性模型(约 614k)和 BPNet 模型(约 114k),但准确度很高。从附图看,与 BPNet 相比 BATv1 在 test count pearson 与 profile pearson 上总体有优势(分箱中位数多在零线以上)。正式对比将出现在后续预印本中。

所属事件:UMass 发布 BATv1:4.6 万参数小模型覆盖 3429 组转录因子结合实验(5 条相关)→

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