epidemik 0.2.0 发布:用字符串定义传染病模型,自动算 R0
bgoncalves · x · 2026-09-17
DataForScience 发布 MIT 协议开源 Python 包 epidemik 0.2.0,用于模拟 compartmental 流行病模型。
- 用交互式字符串定义模型(如 S + I -> I + I),自动完成参数化、计算基础再生数 R0、绘制模型结构图并导出 YAML
- 支持任意舱室模型的交互式与自发转变,参数可为表达式(如 mu="beta/2")
- 同一接口提供确定性 ODE 积分(scipy)与可复现的随机离散仿真,基于 networkx 有向多重图实现
- 支持网络传播、metapopulation 旅行矩阵、时间门控疫苗接种、出生死亡率、季节性forcing、接触矩阵年龄结构、宿主/媒介多群体模型
- pip install epidemik 即可使用,Python 3.8+
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