约翰霍普金斯新预印本:人类基因组发现3022个递归剪接位点
anshulkundaje · x · 2026-09-14
Steven Salzberg 团队在 bioRxiv 发布预印本,由博士生 David Bass 主导,大规模分析人类大脑转录组数据后发现了数千个新的递归剪接(recursive splicing)事件。
- 递归剪接指一个内含子通过两次或多次剪接事件而非一次被移除
- 新方法将 total RNA-seq 数据比对到定制的短"target"序列来检测递归剪接位点
- 共发现 3,022 个 RSS,分布在 2,407 个基因的 2,775 个内含子中,96% 位于蛋白编码基因
- 递归剪接内含子中位长度 10,114 bp,明显长于人类内含子中位数,但远短于以往研究报道的 RS 内含子
- 工作大幅扩充了已知 RSS 数量,并提供了可复用的 RNA-seq 注释流程
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