AG2 消融实验：条件调制需进入编码器，eQTL 召回率近乎翻倍
anshulkundaje · x · 2026-11-12
adamgayoso 分享 AlphaGenome2（AG2）的架构消融结果：仅在解码器或输出头做条件调制，几乎打不过 AG1 这类无条件多任务模型；序列表示必须在编码器和 transformer 阶段就被调制。
- 这种设计带来更强的跨组织/细胞类型特异性（held-out 序列上）
- 变异效应预测收益明显：在 fine-mapped 单细胞 eQTL 数据集 TenK10K 上，90% 精度下 AG2 召回率 30%（微调后 AG1 与 Scooby 为 16%），90% 符号准确率下 43%（对比 23%），几乎翻倍
- 配图展示条件调制路径的消融及 GTEx/TenK10K 上的 eQTL 因果性与符号预测对比
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