斯坦福团队用 200+ ENCODE 数据集训练 ProCapNet，绘制人类转录起始序列图谱
anshulkundaje · x · 2026-11-07
斯坦福 Kundaje 实验室博后首篇论文发布于 bioRxiv：团队在 ENCODE 的全部 PRO-cap 实验上训练了 ProCapNet 深度学习模型集——涵盖 200 多个数据集，覆盖人类所有主要器官和多种癌症类型。
- 转录起始是活跃增强子和启动子的关键标志；该模型能仅从局部 DNA 序列准确预测起始模式
- 模型可解释性强，能解码不同细胞背景下起始位点序列决定因素
- 模型权重与数据已在 Hugging Face 开源（procap-atlas 集合），供研究者直接复用
这是将深度学习大规模应用于基因组调控建模的基础资源型工作。
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