ExPert 论文反向求解扰动因果：从细胞状态溯源疾病驱动因素
anshulkundaje · x · 2026-11-06
西北大学 Yogesh Goyal 团队在 bioRxiv 发布 ExPert 研究（doi: 10.64898/2026.11.02.762549）。多数扰动模型回答的是「敲除基因 X 会怎样」这类前向问题，ExPert 则求解逆问题：给定疾病状态，推断是什么扰动导致的。
核心亮点
- 逆问题求解：从测量的细胞状态反向识别因果扰动，覆盖基因、组合扰动、供体组织、药物筛选等多种上下文。
- 方法架构：结合知识图谱（UniProt、PPI、depmap）等先验进行 zero-shot 编码，encoder-decoder 结构带原型学习。
- 实际案例：将患者细胞溯源至隐藏的肝病生物学机制，以及血液表型背后的线粒体缺陷。
- 团队称模型在未见过的测量状态（跨上下文、组合、难度递增）上保持实用性。
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