基因基础模型 EMBER:上下文基因表示可预测多基因扰动效应
jmuiuc · x · 2026-11-03
eigenNick(与 @jmuiuc、@ericxing 合作)发布 EMBER,一个以基因为中心的预训练基础模型,专门学习上下文特异的基因表示。
要点:
- 核心发现:上下文化基因表示在预测多基因扰动效应上效果出奇地好
- 通过单细胞预训练与数据集筛选的创新训练
- 配轻量 probe 即可完成:单基因敲除预测、遗传相互作用(双敲除)、药物扰动预测
- 作者还发布了推文串与讲解视频
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