基因组「暗物质」破解：语言模型加 AI agent 挖掘非编码 RNA

BrianHie · x · 2026-10-23

Hsu 实验室（pdhsu/Brian Hie 团队）发布重要预印本，用基因组语言模型与 AI agent 进行生物学发现和基因组挖掘。研究对象是蛋白质编码基因之间的 DNA——常被称为基因组「暗物质」：它们并非空无一物，而是编码能感知代谢物、调控基因表达的 RNA 分子，还包括 CRISPR、bridge editor 等可编程基因组编辑工具的生物学基础。难点在于 RNA 即使 DNA 序列剧变仍可保留相似结构与功能，传统计算工具难以识别其关联，而语言模型恰好擅长这种「语义级」的相似性识别。