SPARCS 登 Cell:机器视觉自动关联 7000 万细胞的基因表型
jiqizhixin · x · 2026-10-18
慕尼黑大学与马普生物化学研究所发布 SPARCS(Spatially-resolved CRISPR Screening),10 月 6 日发表于《Cell》。
- 解决的核心瓶颈:全基因组 CRISPR 筛选虽能批量敲除基因,但当表型是复杂的显微图像(而非存活率/荧光这类简单读出)时,如何把图像层面的细胞变化对应到具体基因一直是技术难点。
- 方法:机器学习驱动的显微图像分析 + 自动化细胞回收。流程为在 PPS 膜上铺开突变细胞库、固定成像、分割单细胞、用模型识别相似空间表型,再通过激光显微切割(LMD)或 FACS 回收目标细胞并测序 sgRNA。
- 规模:两项全基因组 CRISPR 敲除筛选共分析约 7000 万个细胞,分别研究自噬体形成与先天免疫激活,自动将每张图像的复杂表型链接到致病基因。
图示验证了 LMD 与 FACS 两种回收路径的 sgRNA 回收率相当(p=0.5135),为 AI for Science 在功能基因组学中的落地提供完整工作流。
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