BARRACUDA 微流控芯片一次捕获百万单细胞,高通量测绘基因线路设计空间
NikoMcCarty · x · 2026-10-15
哈佛医学院团队发布 BARRACUDA 高通量平台:用微流控芯片同时捕获约 100 万个单细胞谱系,结合组合组装、可编程扰动、延时成像与光池筛选,一次实验可采样数万个基因线路设计。
- 核心思路:每个基因线路携带短基因条形码,先测序建立条形码与设计的对应关系;在芯片内用原位测序读出条形码,即可知道每个细胞收到了哪个线路设计
- 工作流:不用传统「设计→转入细胞→失败→重设计」的循环,而是一次性在单管中构建百万变体,观察哪些设计有效,再用光镊挑出「获胜」细胞
- 应用验证:团队用该平台研究逆向积分反馈回路的稳健适应性,筛选出降低宿主应激反应的从头结合子,重建回路表现稳健,2 万多个回路变体划分出不同调控区间
- 意义:为合成生物学的基因线路乃至代谢通路提供可扩展的测试优化方式,作者认为也适合为预测性 AI 模型收集训练数据
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