Arc Institute 为 2026 虚拟细胞挑战赛造高质量 Perturb-seq 数据
anshulkundaje · x · 2026-10-02
Arc Institute 发布 2026 年 Virtual Cell Challenge 的高质量 Perturb-seq 数据生成工作,核心观察是:语言领域算力和数据都在扩张,而生物学领域算力已扩张、数据还没有。
要点:
- 虚拟细胞模型的目标是预测基因突变、环境变化和小分子处理对细胞的影响,填补难以大规模实验的空白,前提是大规模因果性单细胞分辨率数据;
- 2025 年挑战赛是 few-shot 任务:在同一种细胞系里,看过少量扰动图谱后预测未见扰动的转录效应;2026 年跃升为跨 6 种细胞系的 zero-shot 预测,涵盖多个生物学多样性轴;
- 参赛者输入为未扰动细胞的多细胞系转录谱,评分依赖每个细胞语境的高质量真值扰动数据;
- Arc 强调数据质量一致性与覆盖广度是可信预测的第一步,数据集将作为领域资源持续扩充。
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