Baker 团队从头设计半胱氨酸蛋白酶,69 个设计中 13 个成功剪切底物
AllThingsApx · x · 2026-09-26
David Baker 实验室（华盛顿大学蛋白质设计研究所）在 bioRxiv 发布论文，报告了半胱氨酸蛋白酶的从头设计：
- 设计流程：RFD2-MI 用于搭建催化原子与多肽底物的骨架，ProteinMPNN 对酶与底物序列进行协同设计，AlphaFold3 分别校验结合态与非结合态结构。
- 实验结果：挑选的 69 个设计中，13 个能对配对底物进行剪切。
- 开源：作者公开了设计流程与计算分析脚本（不含模型权重），以及动力学与哺乳动物细胞成像分析的实验 notebook。
论文通讯团队包括 Baker，这是计算酶设计（AI for Science）方向的代表性进展。
所属事件:Baker 团队从头设计半胱氨酸蛋白酶并大幅提升活性(2 条相关)→
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