LDDM 药物发现框架经 X 射线验证，Codex 演示设计抗疟分子
mmbronstein · x · 2026-09-22
研究者发布生成式 SBDD（基于结构的药物发现）框架 LDDM（Large Drug Discovery Model），并在 5 个靶点上完成实验验证，成功设计出全新的、经 X 射线确认结构准确性的有效命中分子。预印本已放出。
博主 JacobMolBio 用 Codex 搭配 GPT-6 Astra 做了工具调用演示，让智能体针对疟原虫的二氢乳清酸脱氢酶（恶性疟原虫复制必需的酶）设计小分子：
- 两条路线：从头生成新分子；在已有抑制剂 DSM265（2011 年报道，结合口袋取自 PDB 4RX0）基础上延伸设计
- 生成的候选分子在 PubChem 和 ChEMBL 中无完全匹配，从头设计的分子相似度 >85% 的命中为零
- 还调用 AiZynthFinder、Syntheseus、SynPlanner 等逆合成工具搜索合成路线
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