蛋白质设计工具 BindCraft2 发布,代码即刻开源免费商用
mmbronstein · x · 2026-09-21
PacesaLab 提前于论文发布 BindCraft2,全套代码当天在 GitHub 开源,学术与商业使用均免费,意在让研究者立即用于当前的 Adaptyv 蛋白质设计竞赛。
- 统一工作流:将全新 miniprotein、scaffolded binder、环肽和多状态设计整合到一套流程,描述目标后即可选择 binder 类型并指定实验相关性质,内置命名预设提供设计参数与接受过滤器。
- 技术管线:通过 AlphaFold 2 做序列优化,结合 ProteinMPNN 重设计,再用独立 AlphaFold 模型与结构过滤评估候选,输出序列、预测复合物与排序结果,并给出界面、折叠与分子性质指标辅助筛选。
- 定位:作者提醒这些仍是计算设计,结合性、选择性与目标性质需实验验证。
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