哈佛发布CONCERT模型预测基因扰动空间扩散

哈佛医学院 Marinka Zitnik 团队联合 Manolis Kellis 在 bioRxiv 发布生成模型 CONCERT,可直接在空间转录组数据上预测基因扰动效应如何随时间在组织中跨细胞扩散。技术核心是利用高斯过程核刻画扰动效应的空间扩散半径,因为同一基因敲除在肿瘤核心与组织边界可产生完全不同的响应。在 DSS 结肠炎模型上完成首个人体相关演示,并在基于 Perturb-Map CRISPR 敲除小鼠肺癌数据的实测中,性能超越五个基线方法,显示敲除位置决定肿瘤响应。

2026-10-25 ~ 2026-10-25 · 4 条相关