Kundaje实验室开源GPU加速motif分析工具
斯坦福 Kundaje 实验室开源了 MotifCompendium 及相关工具。其中 FiNeMo 由 Austin T. Wang 开发,利用神经网络模型衍生的贡献得分,在序列中高效准确地定位转录因子结合的 motif 实例,并将其映射到 TF-MoDISco 的 motif,同时建模 motif 竞争关系,实现 GPU 加速的大规模 motif 分析。
2026-09-09 ~ 2026-09-09 · 2 条相关
- GPU 加速工具 Fi-NeMo 从神经网络贡献得分定位转录因子结合位点 — anshulkundaje · 2026-09-09
- Kundaje 实验室开源 MotifCompendium:GPU 加速大规模 motif 分析 — anshulkundaje · 2026-09-09