GPU 加速工具 Fi-NeMo 从神经网络贡献得分定位转录因子结合位点
anshulkundaje · x · 2026-09-09
FiNeMo(by Austin Wang)借助模型贡献得分在序列中高效准确地找到 motif 实例,并将其映射到 TF-MoDISco 的 motif,同时建模 motif 竞争,pre-print 即将发布。技术上它用近端梯度下降求解稀疏线性重构问题的竞争性优化,GPU 加速(PyTorch)处理大规模贡献得分,能识别传统序列法漏掉的低频辅因子 motif。
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