LocoGen 登 NeurIPS:设计活跃、新颖且生物学合理的调控 DNA
mo_lotfollahi · x · 2026-11-14
molotfollahi 团队的 LocoGen 工作(已被 NeurIPS 2026 接收)研究生成模型设计调控 DNA 时,如何保证序列同时满足活跃、新颖和生物学合理。
核心问题:当用预测活性分数引导生成模型时,模型究竟在发现有用的调控序列,还是在钻预测器的空子?他们发现一些方法生成的序列堆满重复 motif、或漂移向 GC 富集组成、motif 多样性收窄——预测活性虽高,但已偏离天然增强子的组成。
因此 LocoGen 主张同时评估三件事:预测活性、新颖性、组成合理性;并通过控制探索发生的位置来引导生成——因为调控 DNA 在不同位置的约束强度并不相同。
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