东京大学团队定量 3.9 万种蛋白表达产量:序列决定因素可被预测
KevinKaichuang · x · 2026-11-13
东京大学团队成员(Selena Setsu、Kaori Kiyokawa、Andy Y. W. Lam、Kotaro Tsuboyama 等)在 bioRxiv 发布预印本《Massively parallel quantification and prediction of monomeric protein yield in Escherichia coli》(doi: 10.64898/2026.11.02.763507),来自东京大学生产技术研究所等机构。
研究在大肠杆菌中大规模并行定量超过 39,000 个样本的单体质粒表达产量,覆盖天然蛋白变异、de novo 人工设计蛋白和纳米抗体。方法上结合条形码蛋白库表达、肽段分离与质谱定量,并利用 MS conversion 将相对质谱强度转换为绝对产量估计。
核心结论:决定蛋白可溶性单体质粒产量的序列因素是可学习的——产量与序列之间的关系可被统计模型捕捉,为从序列预测表达产出、指导蛋白设计提供了数据与方法基础。
所属事件:东京大学大规模定量3.9万种蛋白变异表达产量(2 条相关)→
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