Cherimoya 基因组模型计数性能升至 0.78,VEP 误差近半
jmschreiber91 · x · 2026-10-31
基因组 AI 模型 Cherimoya 团队成员在讨论中披露:通过架构与数据双线优化,计数(count)性能从约 0.72 提升到约 0.78,变异效应预测(VEP)误差几乎减半。他记得的关键改动包括把 max jitter 从 500 降到 50,以及 profile 卷积改用 k=1。讨论还提到,观察性 holdout 上的提升与 VEP 表现常常不相关,可能与同源泄漏(homology leakage)问题有关;细胞类型选择也很关键——学会拟合细胞系 CNA 能涨点但会破坏外部效度。
所属事件:Cherimoya 基因组模型升级：计数性能升至 0.78，但跨物种增益未迁移(5 条相关)→
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