BATv1 基因调控模型遭质疑：超 85% 训练数据来自细胞系
jmschreiber91 · x · 2026-10-31
作者 jmschreiber91 在讨论 BATv1 转录因子-可及性模型时指出其覆盖面的重要局限：超过 85% 的底层实验数据来自细胞系（cell lines），而非原代组织或细胞。配图显示数据分布高度偏斜——ChIP-seq 在细胞系上有约 2931 个实验，而器官样组织（organoid）几乎为零，HepG2、K562 等癌细胞系贡献了绝大多数数据。作者同时提到 BATv1 与 BPNet 一样覆盖了广泛的转录因子家族。这一数据分布失衡意味着模型在真实组织场景的泛化能力存疑。
所属事件:UMass 团队开源 BATv1：4.6 万参数小模型图谱覆盖 3429 组 TF 结合实验(14 条相关)→
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