Nature Genetics 论文:TWAS 推断基因效应方向 20-30% 是错的

anshulkundaje · x · 2026-10-30

斯坦福 Milind、Spence 与 Pritchard 团队在 Nature Genetics 发表论文,系统检验转录组全关联研究(TWAS)推断基因对性状效应方向的准确性。利用血浆蛋白(基因表达升高理应提升蛋白表达)和复合性状(功能缺失负荷测试提供预期方向)两类基准,发现 TWAS 的假符号率分别高达 23% 与 33%,即约四分之一到三分之一的效应方向判断是错的。作者认为不一致大多出现在表达与蛋白调控不一致的情形,提示 TWAS 结果解读需格外谨慎。