新模型从酶序列直接生成反应机制,把功能预测变成生成问题
KevinKaichuang · x · 2026-10-28
Ariane Mora 团队展示了一个可根据酶的氨基酸序列、催化残基、底物与辅因子,直接生成其反应机制的模型。从配图技术框架看:模型将酶反应建模为生成式问题,输入序列嵌入、催化残基编码与键-电子矩阵,经 Graph GPS(MPNN+Transformer)架构输出产物分布、反应性与活性预测;训练数据来自 USPTO、M-CSA 与 EnzymeMap 等数据集,并通过按机制相似性保留测试集来验证模型能否学到通用生化规则、外推到全新化学。
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