figwig 数据格式发布:把 bigwig 推广到 n 维数组,基因组实验文件更小读写更快
jmschreiber91 · x · 2026-10-28
作者发布面向基因组学的 figwig 数据格式,将 bigwig 推广到 n 维数组,可高效存储大量 track、单细胞实验、fiber-seq 乃至 Hi-C 与 scHi-C 实验。
- 核心做法是把多个实验合并进同一数据结构,使文件体积非常小,同时读写速度极快。
- 配图展示了以类似 DataLoader 的对象分块读取数据:小数据集按 8192 个 2048 长度窗口,大数据集按 2048 个 1024 长度窗口。
- 这是作者「连续发布周」中的一项,附带代码/仓库链接。
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