edgePython v0.5.0 发布:比 edgeR 快 4-6 倍,camera 提速超 100 倍
lpachter · x · 2026-10-22
Lior Pachter 宣布 edgePython v0.5.0 发布,可通过 pip install edgepython 安装。该库对标即将发布的 edgeR 5.0,并额外规避了 edgeR 的若干 bug。
主要改进:整体速度提升 4-6 倍,camera 方法提速超过 100 倍,I/O 性能改进,并正式支持 kallisto。这是 RNA-seq 差异表达分析生态从 R 向 Python 迁移的重要一步。
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