PDB 创立 55 周年:15 万实验结构如何喂养 AlphaFold 时代
BrianHie · x · 2026-10-22
PDB-101 十月「本月分子」专题回顾蛋白质结构数据库(PDB)55 周年,梳理结构预测的进化脉络。
- AlphaFold2、RoseTTAFold 等 AI 预测模型本质是模式识别系统,其学习依赖训练时 PDB 中超 15 万个实验测定结构
- 文章以三个案例讲述进展:单条蛋白质链的成功预测(如 CASP 14 中 AlphaFold2 对 SARS-CoV-2 Orf8 的预测,后被 X 射线晶体学证实为二聚体)、柔性分子复合物建模、以及合成基因组构建的噬菌体
- CASP 自 1994 年起每两年举办一次,是结构预测领域的标杆竞赛
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