BioEmu2 模拟蛋白质折叠结合提速超 10 万倍:5 毫秒动力学 40 分钟跑完

FrankNoeBerlin · x · 2026-10-20

Frank Noe 演示 BioEmu2 对内在无序肽与其蛋白受体结合动力学的模拟:经中间态完成折叠与结合,同样的 5 毫秒过程用 MD(分子动力学)模拟需要超过 10 GPU 年,而 BioEmu2 以 5 微秒步长在同一 GPU 上仅需 40 分钟,加速超过 10 万倍。

转发的 Peter Eastman 评价这是「既在意料之中、真看到跑起来又仍然令人惊讶」的技术生物进展。这代表生成式蛋白质动力学模型正在替代部分传统 MD 模拟,把原本以年计的算力压缩到小时级,对药物发现与蛋白相互作用研究意义重大。

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