BioEmu2 自由能面误差约 1 kcal/mol，GPU 分钟复现 GPU 年 MD
FrankNoeBerlin · x · 2026-10-20
BioEmu2 的平衡采样模式：在海量分子动力学（MD）模拟数据上训练，可在 GPU 分钟内复现原本需 GPU 年的 MD 结构分布。
基准测试要点：
- 自由能面预测误差约 1 kcal/mol。
- 结构状态覆盖率达 MD 的 50%–100%（蛋白单体、蛋白二聚体、蛋白-配体三组基准）。
- 与 Boltz-2 (MD)、Boltz-2、Protenix v2 等对比，BioEmu2 在自由能误差和状态覆盖两项上均领先。
- 蛋白-肽复合物（2khw）案例中，BioEmu2 的自由能面覆盖了 MD 中的多个构象态。
所属事件:微软开源 BioEmu2：蛋白质动力学模拟加速超十万倍(15 条相关)→
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