280 个纤维化增强子图谱绘出:CRISPRi CROP-seq 系统扰动 55 万细胞
anshulkundaje · x · 2026-10-20
Gladstone 研究所团队发布 bioRxiv 预印本《A Compact Regulatory Logic Governs Fibroblast Cell State Plasticity in Fibrosis》,研究纤维化中成纤维细胞状态可塑性的调控逻辑。团队整合小鼠与人类表观基因组数据(健康 vs 心衰/TAC 模型、静息 vs 激活成纤维细胞,基于染色质可及性、H3K27Ac、BRD4、新生转录等多组学),筛选出 280 个在人和鼠中保守的疾病激活增强子,再用 CRISPRi CROP-seq 系统扰动(共 549,767 个细胞)并辅以 MPRA 验证增强子活性,样本来自健康供者与心衰/心梗患者成纤维细胞。
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