ENCODE GRAMMAR:用3865组数据集解码人类基因组调控DNA序列逻辑
anshulkundaje · x · 2026-10-15
斯坦福博士生 Chang Yun 将在伯克利 BioML 研讨会(10/19)介绍 ENCODE GRAMMAR——迄今最大规模的调控 DNA 序列模型集合之一。
- ENCODE 项目二十年来绘制了人类与小鼠基因组中数百万个功能活跃的调控区域，但实验图谱并未解释调控活性如何编码在 DNA 序列本身：哪些碱基重要、序列组合如何导致跨细胞类型的行为差异、遗传变异如何改变活性。
- ENCODE GRAMMAR(Genomic Regulatory Atlas of sequence Models, Motifs, Annotations and Rules)覆盖 3865 个实验数据集，横跨多层基因调控，属于“序列到功能”(seq2func)模型。
- 配套的模型解释框架可识别驱动模型预测的序列特征与规则，并展示如何整合多个模型与模态的预测来解码调控序列逻辑。
所属事件:斯坦福发布 ENCODE GRAMMAR 解码基因调控序列语法(2 条相关)→
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