斯坦福发布 ENCODE GRAMMAR:3865 组数据解码基因调控序列语法
anshulkundaje · x · 2026-10-15
Berkeley BioML 研讨会将由斯坦福博士生 Chang Yun 主讲 ENCODE GRAMMAR(Genomic Regulatory Atlas of sequence Models, Motifs, Annotations and Rules),这是迄今规模最大的调控 DNA 序列模型资源之一。
- 基于 ENCODE 项目二十年积累的 3,865 个实验数据集,构建覆盖基因调控多层次的 seq2func 模型集合
- 配套模型解释框架,识别驱动预测的序列特征与组合规则,回答哪些 DNA 碱基重要、排列组合如何导致跨细胞类型差异、遗传变异如何改变活性等问题
- 展示如何跨模型与模态整合预测与解释,规模化解码调控活动的序列基础
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