Joseph Jacks 长文：AlphaFold 与 ESM 等序列模型漏掉了什么

JosephJacks_ · x · 2026-10-13

Joseph Jacks 转发自己的文章《Runtime Biology：AlphaFold 与 ESM、Evo 等序列模型未能捕捉的东西》。文章借用 Feynman「自然不是经典的，要模拟就得用量子力学」的名言，论证基于序列的模型无法捕捉细胞在运行时（活体、三维、动态）状态下的真实行为。同帖中还提到 Manu Prakash 实验室 2020 年的 Gravity Machine：传统显微镜把细胞压在载玻片上成像，而细胞在自然环境中是在三维空间移动的，这一工具展示了改变观测方式能带来更易的发现。