HGR 框架用高阶文法序列化分子拓扑,生成Validity 100%
CatAstro_Piyush · x · 2026-10-02
Leskovec 等人发布预印本《Higher-Order Molecular Grammars for Generative and Foundation Models in Chemistry》,提出高阶文法表示 HGR(Higher-order Grammar Representation):
- 核心思路:把分子提升为组合复形(combinatorial complexes),再在上下文无关的高阶文法下解析为紧凑的产生式规则序列,从而将环系等高阶拓扑序列化,直接兼容标准序列模型,避免显式高阶编码的计算开销。
- 新基准:针对现有基准偏向简单环系统的问题,构建含 118 万分子的环富集基准 RingDiv(含 RingDiv300k 子集),并提出环多样性指数 RDI 量化环系覆盖度。
- 生成结果:HGR 模型天然保证 100% 化学有效性,分布对齐领先,在全部五个生成基准的 FCD 指标上排名第一,在表征学习上也有提升。
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