Heng Li 团队发布 minisplice:仅 7k 参数 CNN 将 minimap2 剪接错误率减半
anshulkundaje · x · 2026-09-24
Heng Li(lh3)团队的论文《Improving spliced alignment by modeling splice sites with deep learning》正式发表于 Algorithms for Molecular Biology。
- 团队实现 minisplice,用一维 CNN 学习剪接信号,模型仅 7026 个参数,覆盖脊椎动物与昆虫基因组
- 模型能捕捉跨门的保守剪接信号,并揭示哺乳动物和鸟类特有的 GC 富集内含子
- 用模型为基因组中每个 GT/AG 估算经验剪接概率,minimap2 和 miniprot 现已可选用该分数改进剪接比对
- 在人长读长 RNA-seq 数据和跨物种蛋白datasets上评估,连接点准确率显著提升,对噪声大的长读长 reads 和远源同源蛋白改善尤其明显
开源地址:github.com/lh3/minisplice。作者称自己已日常使用该新功能。
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