Ensemble-Conditioned 框架重构分子设计,同时优化构象系综的形态与性质
_onionesque · x · 2026-09-23
论文核心
AstraZeneca 相关团队（Ross Irwin、Alessandro Tibo、Jon Paul Janet 等，与 Simon Olsson 合作）发布论文《Ensemble-Conditioned Molecular Design》。
- 问题重构：分子设计通常被当作寻找单一生物活性构象的问题，但实际上分子占据一个构象分布，候选分子能否成立取决于整个分布而非单一构象。
- 方法：提出 ensemble-conditioned guidance 框架，同时对构象系综的"模式"（shape、药效团、蛋白口袋）和"性质"（对整个分布聚合的标量）进行优化；推理时通过组合各条件的向量场自适应地叠加任意数量的条件，可混搭模态、指定目标或规避。
- 技术要点：引入 adaptive symmetry learning 组合不同参考系的条件；扩展生成框架支持可变长度生成分子的结构单元。
- 评测与应用：发布了多模式条件与系综性质优化的新 benchmark，并在双靶点结合剂设计、活性态选择性激动剂设计两个真实药物发现任务上验证，加入状态条件均带来提升。
论文与代码均已公开。
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