斯坦福学者公开质疑:TRACEBIND 论文未引用也不对比 ChromBPNet
anshulkundaje · x · 2026-09-23
计算生物学家 Anshul Kundaje 连发四贴质疑 Nancy Zhang 组发表的 TRACEBIND 论文(Tn5 偏差校正用于 ATAC-seq,2025 年 10 月挂预印本,2026 年 6 月登 Nature Communications):
- 未引用先有工作:其团队的 ChromBPNet 代码 2023 年 1 月已发布、预印本 2024 年 12 月放出、且被多篇 2025 年 10 月前的论文使用,但 TRACEBIND 既未引用也未与之对比。
- 对比对象离谱:论文反而选择与 DECIMA 对比——而 DECIMA 根本不是用染色质可及性数据训练的。
- 同行评审失灵:作者质疑如此明显的遗漏为何 Nature Communications 的同行评审没有发现任何问题。
这是一起典型的学术引用争议,涉及顶刊评审对基线对比的把关。
所属事件:斯坦福学者公开质疑:TRACEBIND 论文未引用也不对比 ChromBPNet(2 条相关)→
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