实测对比基因组模型：AlphaGenome 去蒸馏后仅居中游

jeffvierstra · x · 2026-09-19

研究者 jeffvierstra 在与 Anshul Kundaje、Steven Salzberg 的讨论中分享了对 AlphaGenome 等基因组模型的实测结果：在跨多种细胞类型的特异性 peaks 任务上 chromBPNet 表现最好；而在开放染色质变异效应预测任务上，若剥离模型蒸馏因素，AlphaGenome 只处于中游水平。进一步检查发现各模型的变异相关性（带符号 Pearson r）基本相同，蒸馏只是调整了其他模型的噪声。作者指出 AlphaGenome 不公开蒸馏前的模型，无法精确验证。