五年回顾：ML 辅助定向进化为何始终落地困难

anshulkundaje · x · 2026-09-06

Bruce Wittmann 在 arXiv 发布五周年回顾论文《Advances in Machine Learning for Directed Evolution: A Five-Year Retrospective》。他指出机器学习已改变蛋白质工程多个方向，却未真正惠及定向进化，核心原因是目标错位：MLDE 研究者追求「找出最优蛋白」，而实际定向进化是在时间与资源约束下「找出足够好的蛋白」。他举例称几乎所有现有 MLDE 方法都忽略 DNA 合成成本，导致模型再强也缺乏实用价值，并列举了少数例外工作，主张重新框定 MLDE 目标与既有 ML 进展并不冲突。