Mojo 与 LLM 赋能基因组学，AffineGaps 库实现高性能序列比对

clattner_llvm · x · 2026-08-25

Chris Lattner 转发了 Ash Vardanian 使用 Mojo🔥 结合 LLM 编码解决基因组学问题的实践。Ash 发布了 AffineGaps 库，这是一个基于 Mojo 的高性能生物序列对齐工具，构建在 StringZilla 等研究基础上。该库针对 Gotoh 仿射空位罚分扩展进行了优化，支持在 CPU 和 GPU 上实现精确的 Needleman-Wunsch 和 Smith-Waterman 算法，并具备回溯能力，解决了 StringZilla 仅能计算分数无法输出对齐结果的局限。