CLSS 模型：将蛋白质序列与结构映射至同一 AI 空间
bravo_abad · x · 2026-08-07
Guy Yanai 等研究者提出了 CLSS，一种能够同时学习蛋白质序列、结构及其子序列共享表示的对比蛋白质语言模型。
技术架构与训练
- 采用双塔架构，分别处理蛋白质的序列与结构信息。
- 通过对比学习训练，在隐空间中将匹配的序列-结构对拉近，不相关的蛋白质推远。
- 在 100 万个蛋白质结构域上进行自监督训练，未使用 ECOD 或 CATH 标签。
效果与意义
CLSS 不仅仅是实现了多模态对齐，它还构建了一个统一的“蛋白质空间”。在该空间中，序列和结构呈现出高度一致的全局组织方式，并能恢复出模型在训练期间从未见过的、由专家策划的进化层级。
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