为每个蛋白质设计结合剂:Human Bindome 开源
jajoosam · x · 2026-08-03
Human Bindome 是一个蛋白质组级别的结合蛋白(binder)候选图谱,旨在为人类蛋白质组中的每一个蛋白质提供开源的结合剂。
- 数据规模:包含超过 30 万个(306,146)经过计算设计的结合蛋白候选,覆盖了 8,296 种人类蛋白质(约占蛋白质组的 40% 以上)。
- 设计动机:传统的抗体试剂通常昂贵、表征不一且缺乏公开序列,导致实验难以复现。该项目旨在提供序列明确、可大规模获取的替代方案。
- 技术细节:所有候选蛋白均由经过实验基准测试的 BindCraft 流程生成,长度固定为 90 个氨基酸。每个候选者都包含明确的氨基酸序列、预测的靶点结合结构模型以及计算置信度指标。
- 开源资源:项目已在 GitHub 上开源相关代码,并提供了 Hugging Face 数据集、交互式网站以及 MCP 服务,方便科研人员直接调用。
作者呼吁更多团队通过噬菌体展示或酵母展示等湿实验方法,来验证这些候选蛋白的靶向活性。
「研究」频道最新
- 陶哲轩 ICM 演讲:探讨 AI 时代的数学研究 — alejandroll10 · 2026-08-03
- 阿里 GALA 框架:用强化学习对齐多模态特征提升推荐精度 — _reachsumit · 2026-08-03
- 快手 RecHarness:用 LLM 自动迭代推荐系统架构 — _reachsumit · 2026-08-03
- HyPE 新方法:将 RAG 检索转化为问题匹配,精度提升 42% — _reachsumit · 2026-08-03
- 开源工具 Pose2Sim:普通摄像头实现 3D 无标记动作捕捉 — tom_doerr · 2026-08-03
- 别盲信跑分:专家警告大模型评测工具差异会严重扭曲成绩 — cedric_chee · 2026-08-03