Science 论文揭示阿尔茨海默病单细胞 3D 基因组重组
jmuiuc · x · 2026-07-24
作者分享了一篇发表在 Science 的论文，主题是 阿尔茨海默病中的单细胞 3D 基因组重组。
论文主要做了几件事：
- 使用 GAGE-seq 在单个人类脑细胞中同时测量 基因表达 与 3D 基因组结构。
- 将这些数据与 染色质可及性 和 空间转录组 结合分析。
- 结果发现，阿尔茨海默病中出现了更强的 compartment mingling，以及随距离变化的基因调控接触重连。
论文还提出了一个 Hicformer：
- 这是一个 transformer 模型，
- 将 DNA 序列 与 3D genome features 结合，
- 可用于预测细胞类型特异的基因表达，并筛选候选调控元件。
这是一条典型的 AI for Science / 基因组学研究进展帖。
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