Science 论文揭示阿尔茨海默病的单细胞 3D 基因组重连
jmuiuc · x · 2026-07-24
一篇发表在 Science 的论文研究了阿尔茨海默病中的单细胞 3D 基因组重组。
研究团队在单个人类脑细胞中同时测量了基因表达和 3D 基因组结构，并结合染色质可及性与空间转录组数据进行整合分析。结果发现，AD 中存在更明显的 compartment mingling，以及随距离变化的基因调控接触重连。
论文还提出了 Hicformer：一个结合 DNA 序列与 3D 基因组特征的 transformer 模型，用于预测细胞类型特异性基因表达，并优先筛选候选调控元件。
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