Baker 团队连发两篇 Nature，AI 从头设计蛋白酶
10 月 14 日，2024 年诺贝尔化学奖得主 David Baker 团队在 Nature 同日发表两篇论文，用生成式 AI 从头设计出自然界不存在的蛋白酶（"分子剪刀"），可切割与阿尔茨海默病、ALS 相关的蛋白。
已确认
- 两篇论文分别聚焦金属蛋白酶与半胱氨酸蛋白酶的从头计算设计
- 金属蛋白酶：69 个设计中 13 个成功（约 36% 成功率），最佳设计将反应加速约 1 亿倍，再修改 4 个位点后达约 100 亿倍；不过多数设计仍弱于天然酶
- 半胱氨酸蛋白酶：成功率 19%，在哺乳动物细胞中具备功能；方法上从天然酶借用催化原子几何结构，用 RFdiffusion 等生成式模型设计，肽键在中性水中半衰期可达数百年，是生成式 AI 的严苛考验
- 金属蛋白酶论文（Chen 等）还揭示：结构预测中一个被忽略的水分子足以误导 AI 酶设计——设计的酶用锌激活水分子切割蛋白链，水必须与肽段正确并置；修正后活性命中率从 15% 跃升至 88%
为什么重要
- 这被视为生成式 AI 在蛋白质设计领域从"折叠预测"走向"创造全新功能分子"的标志性进展
- 网络讨论中也有人质疑这是否算"真 AI"成果，@gerardsans 等作者转述了这一争论，说明学界对生成式设计方法的定位仍有分歧
2026-10-15 ~ 2026-10-15 · 6 条相关
一手来源
- David Baker 团队用扩散模型从头设计蛋白酶,69 个设计中 13 个成功 — bravo_abad ·
- David Baker 团队一天连发两篇 Nature,AI 从头设计蛋白酶成功 — IgorCarron ·
- Nature 论文:漏掉一个水分子,AI 设计酶活性命中率从 15% 跃至 88% — bravo_abad ·
- Baker 实验室连发两篇 Nature:计算从头设计金属蛋白酶与半胱氨酸蛋白酶 — ArashVahdat · 2026-10-15
- 诺奖得主 David Baker 用 AI 从零设计分子剪刀：反应加速约 100 亿倍 — fanofaliens · 2026-10-15
- 【源头】David Baker 团队用扩散模型从头设计蛋白酶,69 个设计中 13 个成功 — bravo_abad · 2026-10-15
- 【源头】Nature 论文:漏掉一个水分子,AI 设计酶活性命中率从 15% 跃至 88% — bravo_abad · 2026-10-15
- AI 从零设计出自然界不存在的分子剪刀，网友却在争论这算不算真 AI — gerardsans · 2026-10-15
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