Geodesic 发布 NovaAtom-Lite：抗体-抗原预测大幅超越 AlphaFold 3
QuanquanGu · x · 2026-11-11
Geodesic Intelligence 发布全原子结构预测模型 NovaAtom-Lite，面向药物发现：给定蛋白、DNA、RNA 链及小分子配体的序列，预测每个重原子的 3D 坐标，并提供 pLDDT、PAE、ipTM 等置信度输出。
关键成绩（FoldBench 抗体-抗原结构预测，DockQ ≥ 0.23，训练数据截止与 AlphaFold 3 相同的 2021-09-30）：
- NovaAtom-Lite：79.07%（n=172）
- IsoDDE：75.58%
- AlphaFold 3：47.90%（n=167）
评测采用 5 seeds × 5 samples，按模型自身 ranking score 选 top-1。优势集中在药物发现最关心的界面预测：抗体-抗原、蛋白-小分子配体的结合方式。模型已通过 Geodesic API 和 NovaDDE 平台开放使用。
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