每日一个Agent第19天:用夜间自动化agent做测序QC
nlarusstone · x · 2026-11-07
「An agent a day」系列第 19 天,作者构建一个分子生物学测序质检(sequencing QC)agent,解决 CRO 质检曾把序列数量算错 20 倍这类痛点——以前靠人工、脆弱脚本或生信同事,现在可以交给 agent。
作者给出完整可用提示词,要点包括:
- agent 每晚运行,扫描过去一天更新的 notebook 条目
- 发现未 QC 的新测序结果(Sanger .ab1 文件或全质粒 reads)后,自动与条目中引用的目标序列比对
- 对纳米孔等高错误率读段,从跨读段共识而非单条 reads 调用变异
- 在条目中追加简短总结:哪些克隆匹配,标记错配、indel 或低质量区域
- 无法确定比对目标时,在条目中注明而不是瞎猜
展示了 agent 在湿实验室/生物信息日常工作流中的落地方式。
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