斯坦福团队发 Nature Genetics：CORAL 模型整合多尺度空间组学数据
james_y_zou · x · 2026-11-07
斯坦福 James Zou 团队在 Nature Genetics 发表 CORAL，一个连接生物多尺度、多模态数据的概率深度生成模型。
- 方法：利用图注意力（graph attention）整合空间转录组、蛋白质组、代谢组与表观基因组数据，跨空间尺度联合建模「高分辨率但分子覆盖有限」与「低分辨率但全基因组覆盖」的数据集，推断细胞生态位、细胞间相互作用，并补全缺失数据。
- 应用：应用于空间转录组+蛋白质组数据，识别出与肝癌免疫治疗耐药相关的细胞类型。
- 论文代码已开源。
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