陌生人免费帮癌症患者用开源 AI 建模ALK耐药突变,设计后备药物
anshulkundaje · x · 2026-11-06
癌症患者 @kevinace 透露:一位陌生人 Jan Domanski 主动私信,免费帮他用开源 AI 建模后备抗癌药。Domanski 运营 OpenFold——一个预测蛋白质与药物如何物理结合的开源 AI 模型。
他的癌症由 ALK 突变蛋白驱动,日常服用 Lorlatinib 靶向抑制,但耐药突变迟早会出现。Domanski 自费算力跑 AI 模型,模拟 ALK 与 Lorlatinib 的结合,定位已知耐药突变位点。
关键发现:大多数突变都落在药物结合口袋内,通过把小的氨基酸片段换成更大的片段来物理阻挡药物——而口袋问题是可以通过重新设计药物来解决的「好的坏消息」。配图展示了 PDB 4CLI 晶体结构中 Lorlatinib 与 11 个已知耐药位点的距离分析(七个位点直接接触药物),使用了 ESMFold2、OpenBind-0、Protenix-v2 等多个共折叠模型。
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