斯坦福团队开源 SMFNet:离散扩散模型生成单分子足迹测序读段

anshulkundaje · x · 2026-11-06

Anshul Kundaje 实验室发布 SMFNet 的官方开源实现(GitHub,MIT 协议):一个离散扩散模型,以 DNA 序列为输入(2048bp),生成中心 1024bp 区域的单分子足迹(SMF)读段分布,每个读段逐位点标注分子被保护或可及。采样大量读段可呈现序列编码的分子状态范围而非仅平均可及性。模型支持三种实验类型训练,包括 Nanopore SMF(CpG/GpC 甲基酶)等。

所属事件:斯坦福与EMBL发布SMFNet:扩散模型预测单分子染色质可及性(7 条相关)→

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